Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN8OSP0DMR3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN8OSP0DMR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATXN8OSP0DMR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATXN8OSP0DMR3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN8OSP0DMR3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN8OSP0DMR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN8OSP0DMR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN8OSP0DMR3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN8OSP0DMR3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATXN8OSP0DMR3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN8OSP0DMR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN8OSP0DMR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN8OSP0DMR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATXN8OSP0DMR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN8OSP0DMR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN8OSP0DMR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN8OSP0DMR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN8OSP0DMR3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN8OSP0DMR3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN8OSP0DMR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN8OSP0DMR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN8OSP0DMR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN8OSP0DMR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN8OSP0DMR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN8OSP0DMR3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN8OSP0DMR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN8OSP0DMR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN8OSP0DMR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATXN8OSP0DMR3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN8OSP0DMR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN8OSP0DMR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN8OSP0DMR3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN8OSP0DMR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN8OSP0DMR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN8OSP0DMR3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN8OSP0DMR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN8OSP0DMR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN8OSP0DMR3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN8OSP0DMR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN8OSP0DMR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN8OSP0DMR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN8OSP0DMR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN8OSP0DMR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN8OSP0DMR3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN8OSP0DMR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN8OSP0DMR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATXN8OSP0DMR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN8OSP0DMR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATXN8OSP0DMR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN8OSP0DMR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATXN8OSP0DMR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATXN8OSP0DMR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN8OSP0DMR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATXN8OSP0DMR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN8OSP0DMR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN8OSP0DMR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN8OSP0DMR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN8OSP0DMR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN8OSP0DMR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms