Protein–RNA interactions for Protein: P08905

Lyz2, Lysozyme C-2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyz2P08905 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Lyz2P08905 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lyz2P08905 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lyz2P08905 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lyz2P08905 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lyz2P08905 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lyz2P08905 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lyz2P08905 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lyz2P08905 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lyz2P08905 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lyz2P08905 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lyz2P08905 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lyz2P08905 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lyz2P08905 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lyz2P08905 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lyz2P08905 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lyz2P08905 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lyz2P08905 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lyz2P08905 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lyz2P08905 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lyz2P08905 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Lyz2P08905 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lyz2P08905 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lyz2P08905 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lyz2P08905 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lyz2P08905 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lyz2P08905 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lyz2P08905 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lyz2P08905 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lyz2P08905 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lyz2P08905 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lyz2P08905 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lyz2P08905 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lyz2P08905 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lyz2P08905 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lyz2P08905 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lyz2P08905 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lyz2P08905 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lyz2P08905 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lyz2P08905 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lyz2P08905 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lyz2P08905 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lyz2P08905 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lyz2P08905 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lyz2P08905 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Lyz2P08905 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lyz2P08905 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lyz2P08905 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lyz2P08905 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lyz2P08905 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lyz2P08905 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lyz2P08905 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lyz2P08905 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lyz2P08905 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lyz2P08905 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lyz2P08905 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lyz2P08905 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lyz2P08905 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lyz2P08905 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lyz2P08905 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lyz2P08905 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lyz2P08905 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lyz2P08905 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lyz2P08905 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lyz2P08905 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lyz2P08905 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lyz2P08905 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lyz2P08905 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lyz2P08905 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lyz2P08905 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lyz2P08905 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lyz2P08905 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lyz2P08905 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lyz2P08905 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lyz2P08905 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lyz2P08905 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lyz2P08905 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lyz2P08905 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lyz2P08905 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lyz2P08905 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lyz2P08905 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lyz2P08905 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lyz2P08905 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lyz2P08905 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lyz2P08905 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lyz2P08905 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lyz2P08905 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lyz2P08905 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lyz2P08905 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lyz2P08905 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lyz2P08905 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lyz2P08905 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lyz2P08905 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lyz2P08905 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lyz2P08905 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lyz2P08905 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lyz2P08905 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lyz2P08905 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lyz2P08905 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lyz2P08905 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms