Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEFMP07197 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NEFMP07197 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEFMP07197 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEFMP07197 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEFMP07197 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NEFMP07197 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NEFMP07197 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NEFMP07197 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NEFMP07197 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEFMP07197 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEFMP07197 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEFMP07197 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEFMP07197 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEFMP07197 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEFMP07197 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEFMP07197 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEFMP07197 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEFMP07197 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEFMP07197 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NEFMP07197 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEFMP07197 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NEFMP07197 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NEFMP07197 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NEFMP07197 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEFMP07197 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEFMP07197 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NEFMP07197 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NEFMP07197 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEFMP07197 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEFMP07197 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEFMP07197 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEFMP07197 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NEFMP07197 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NEFMP07197 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NEFMP07197 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEFMP07197 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NEFMP07197 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
NEFMP07197 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NEFMP07197 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NEFMP07197 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEFMP07197 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NEFMP07197 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEFMP07197 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEFMP07197 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NEFMP07197 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NEFMP07197 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEFMP07197 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NEFMP07197 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEFMP07197 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NEFMP07197 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NEFMP07197 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NEFMP07197 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEFMP07197 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEFMP07197 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEFMP07197 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NEFMP07197 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEFMP07197 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEFMP07197 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NEFMP07197 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NEFMP07197 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEFMP07197 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEFMP07197 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEFMP07197 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
NEFMP07197 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEFMP07197 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEFMP07197 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEFMP07197 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEFMP07197 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEFMP07197 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEFMP07197 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEFMP07197 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEFMP07197 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEFMP07197 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEFMP07197 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEFMP07197 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEFMP07197 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEFMP07197 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NEFMP07197 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NEFMP07197 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEFMP07197 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEFMP07197 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEFMP07197 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NEFMP07197 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEFMP07197 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEFMP07197 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEFMP07197 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEFMP07197 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
NEFMP07197 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEFMP07197 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEFMP07197 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEFMP07197 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEFMP07197 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NEFMP07197 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEFMP07197 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEFMP07197 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEFMP07197 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEFMP07197 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEFMP07197 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEFMP07197 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms