Protein–RNA interactions for Protein: P01881

Ig delta chain C region secreted form, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01881 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
P01881 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
P01881 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01881 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
P01881 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
P01881 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
P01881 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P01881 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01881 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P01881 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01881 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P01881 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P01881 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P01881 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P01881 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
P01881 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P01881 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P01881 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P01881 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P01881 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P01881 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
P01881 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01881 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P01881 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01881 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01881 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01881 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
P01881 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01881 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01881 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01881 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01881 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01881 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01881 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01881 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
P01881 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01881 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P01881 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01881 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01881 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
P01881 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01881 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01881 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01881 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
P01881 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01881 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01881 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01881 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01881 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01881 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01881 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01881 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P01881 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01881 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01881 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01881 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01881 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01881 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01881 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01881 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01881 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01881 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01881 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01881 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01881 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01881 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01881 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01881 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01881 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01881 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01881 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01881 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01881 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01881 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P01881 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01881 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01881 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01881 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01881 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01881 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01881 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01881 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01881 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01881 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01881 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01881 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01881 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01881 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01881 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01881 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01881 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01881 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01881 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01881 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01881 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01881 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01881 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01881 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01881 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01881 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms