Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Psma3O70435 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Psma3O70435 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Psma3O70435 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Psma3O70435 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Psma3O70435 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Psma3O70435 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Psma3O70435 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Psma3O70435 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Psma3O70435 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Psma3O70435 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Psma3O70435 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Psma3O70435 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Psma3O70435 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Psma3O70435 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Psma3O70435 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Psma3O70435 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Psma3O70435 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Psma3O70435 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Psma3O70435 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psma3O70435 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Psma3O70435 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Psma3O70435 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Psma3O70435 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psma3O70435 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Psma3O70435 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Psma3O70435 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Psma3O70435 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Psma3O70435 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Psma3O70435 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Psma3O70435 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psma3O70435 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Psma3O70435 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Psma3O70435 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Psma3O70435 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Psma3O70435 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Psma3O70435 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psma3O70435 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Psma3O70435 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Psma3O70435 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psma3O70435 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psma3O70435 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Psma3O70435 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Psma3O70435 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Psma3O70435 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Psma3O70435 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Psma3O70435 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Psma3O70435 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Psma3O70435 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psma3O70435 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Psma3O70435 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psma3O70435 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psma3O70435 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Psma3O70435 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Psma3O70435 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psma3O70435 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psma3O70435 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psma3O70435 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psma3O70435 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psma3O70435 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Psma3O70435 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psma3O70435 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psma3O70435 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psma3O70435 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psma3O70435 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psma3O70435 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Psma3O70435 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psma3O70435 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psma3O70435 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psma3O70435 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Psma3O70435 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Psma3O70435 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psma3O70435 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psma3O70435 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Psma3O70435 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Psma3O70435 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psma3O70435 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Psma3O70435 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Psma3O70435 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psma3O70435 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psma3O70435 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psma3O70435 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Psma3O70435 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psma3O70435 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psma3O70435 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psma3O70435 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psma3O70435 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psma3O70435 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psma3O70435 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psma3O70435 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psma3O70435 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Psma3O70435 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psma3O70435 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psma3O70435 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psma3O70435 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psma3O70435 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psma3O70435 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psma3O70435 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psma3O70435 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psma3O70435 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms