Protein: O60508

CDC40, Pre-mRNA-processing factor 17, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC40O60508 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.889e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 519.34■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 212.39□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 36.4
CDC40O60508 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 36.3
CDC40O60508 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 36.3
CDC40O60508 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 36.3
CDC40O60508 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.964e-10■■■■■ 36.2
CDC40O60508 CYP4V2-203ENST00000507209 8646 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.084e-10■■■■■ 36.2
CDC40O60508 TNS1-216ENST00000480665 758 ntTSL 213.95□□□□□ -0.187e-10■■■■■ 36.2
CDC40O60508 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 36.2
CDC40O60508 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-9■■■■■ 36.2
CDC40O60508 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-9■■■■■ 36.2
CDC40O60508 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 36.2
CDC40O60508 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 35.9
CDC40O60508 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 35.9
CDC40O60508 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 35.9
CDC40O60508 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 35.9
CDC40O60508 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 35.8
CDC40O60508 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 48.73□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 35.8
CDC40O60508 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-80■■■■■ 35.8
CDC40O60508 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 35.8
CDC40O60508 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 35.8
CDC40O60508 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.33e-80■■■■■ 35.7
CDC40O60508 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 ANKMY1-213ENST00000418505 568 ntTSL 421.16■□□□□ 0.985e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 221.11■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 221.11■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 319.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 218.5■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 ANKMY1-219ENST00000464991 1221 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 518.19■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 418.19■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 316.44■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 216.27■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 PLXNB2-205ENST00000432455 1620 ntTSL 516.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 ANKMY1-212ENST00000411765 652 ntTSL 415.17■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 213.48□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 CAPN15-206ENST00000568402 540 ntTSL 413.16□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 LAMP1-202ENST00000471046 424 ntTSL 312.01□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 310.78□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 39.65□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 XRCC5-209ENST00000485763 616 ntTSL 26.33□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 34.4
CDC40O60508 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.684e-8■■■■■ 34.2
CDC40O60508 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 34.2
CDC40O60508 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.123e-9■■■■■ 34
CDC40O60508 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.627e-7■■■■■ 33.7
CDC40O60508 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 33.7
CDC40O60508 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 33.7
CDC40O60508 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 33.7
CDC40O60508 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 CTSA-207ENST00000484855 2183 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 CTSA-210ENST00000606000 644 ntTSL 311.36□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 33.2
CDC40O60508 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 33
CDC40O60508 PLXNB2-203ENST00000425954 609 ntTSL 216.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 33
CDC40O60508 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 33
CDC40O60508 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 33
CDC40O60508 INSR-205ENST00000598216 2961 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 33
CDC40O60508 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 33
CDC40O60508 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 220.99■□□□□ 0.953e-17■■■■■ 32.9
CDC40O60508 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 215.87■□□□□ 0.133e-17■■■■■ 32.9
CDC40O60508 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 314.08□□□□□ -0.166e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 513.97□□□□□ -0.176e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 TRIM15-208ENST00000433744 491 ntTSL 312.64□□□□□ -0.396e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.576e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 39.07□□□□□ -0.966e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 WDR73-204ENST00000558487 564 ntTSL 28.81□□□□□ -16e-9■■■■■ 32.9
CDC40O60508 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 32.5
CDC40O60508 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 217.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 32.5
CDC40O60508 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 32.5
CDC40O60508 CFB-272ENST00000452035 1866 ntTSL 214.43□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 CFB-278ENST00000472581 1059 ntTSL 214.06□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 CFB-273ENST00000460718 768 ntTSL 510.56□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 CFB-279ENST00000475617 586 ntTSL 46.76□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 32.3
CDC40O60508 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 32
CDC40O60508 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 514.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 32
CDC40O60508 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 31.9
CDC40O60508 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 31.8
CDC40O60508 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 31.8
CDC40O60508 FAM19A5-205ENST00000473898 897 ntTSL 218.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 31.8
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