Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc6a2O55192 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc6a2O55192 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc6a2O55192 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc6a2O55192 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc6a2O55192 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc6a2O55192 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc6a2O55192 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc6a2O55192 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc6a2O55192 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc6a2O55192 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc6a2O55192 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc6a2O55192 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc6a2O55192 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc6a2O55192 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc6a2O55192 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc6a2O55192 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc6a2O55192 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc6a2O55192 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc6a2O55192 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc6a2O55192 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc6a2O55192 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc6a2O55192 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc6a2O55192 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc6a2O55192 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc6a2O55192 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc6a2O55192 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc6a2O55192 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc6a2O55192 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc6a2O55192 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc6a2O55192 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc6a2O55192 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc6a2O55192 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc6a2O55192 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc6a2O55192 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc6a2O55192 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc6a2O55192 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc6a2O55192 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms