Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUV39H1O43463 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUV39H1O43463 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUV39H1O43463 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUV39H1O43463 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUV39H1O43463 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUV39H1O43463 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUV39H1O43463 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SUV39H1O43463 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUV39H1O43463 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUV39H1O43463 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUV39H1O43463 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUV39H1O43463 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUV39H1O43463 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUV39H1O43463 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUV39H1O43463 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SUV39H1O43463 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SUV39H1O43463 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUV39H1O43463 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUV39H1O43463 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUV39H1O43463 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUV39H1O43463 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms