Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97not detected
RBFOX2O43251 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93not detected
RBFOX2O43251 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89not detected
RBFOX2O43251 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88not detected
RBFOX2O43251 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87not detected
RBFOX2O43251 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84not detected
RBFOX2O43251 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.831e-10■□□□□ 10.6
RBFOX2O43251 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8not detected
RBFOX2O43251 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.795e-8■■■■■ 28.4
RBFOX2O43251 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.781e-10■□□□□ 10.6
RBFOX2O43251 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77not detected
RBFOX2O43251 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.752e-15■□□□□ 8.4
RBFOX2O43251 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 105.9
RBFOX2O43251 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.712e-6■□□□□ 9.3
RBFOX2O43251 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.716e-13■■■□□ 15.5
RBFOX2O43251 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7not detected
RBFOX2O43251 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7not detected
RBFOX2O43251 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68not detected
RBFOX2O43251 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67not detected
RBFOX2O43251 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67not detected
RBFOX2O43251 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.672e-9■■■□□ 17.9
RBFOX2O43251 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66not detected
RBFOX2O43251 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.662e-6■□□□□ 9.5
RBFOX2O43251 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.659e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64not detected
RBFOX2O43251 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.614e-9■■■■■ 40.4
RBFOX2O43251 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61not detected
RBFOX2O43251 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61not detected
RBFOX2O43251 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58not detected
RBFOX2O43251 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.574e-7■■□□□ 13.7
RBFOX2O43251 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57not detected
RBFOX2O43251 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57not detected
RBFOX2O43251 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.569e-6■■□□□ 11.7
RBFOX2O43251 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.562e-6■■□□□ 13
RBFOX2O43251 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56not detected
RBFOX2O43251 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56not detected
RBFOX2O43251 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.565e-6■■■■■ 29.4
RBFOX2O43251 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 22.3
RBFOX2O43251 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54not detected
RBFOX2O43251 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53not detected
RBFOX2O43251 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.531e-8■■■□□ 16.6
RBFOX2O43251 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.523e-8■■□□□ 14
RBFOX2O43251 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.523e-11■■□□□ 14.3
RBFOX2O43251 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51not detected
RBFOX2O43251 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49not detected
RBFOX2O43251 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49not detected
RBFOX2O43251 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49not detected
RBFOX2O43251 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49not detected
RBFOX2O43251 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.484e-7■■□□□ 13.7
RBFOX2O43251 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47not detected
RBFOX2O43251 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47not detected
RBFOX2O43251 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.471e-8■■■□□ 16.6
RBFOX2O43251 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47not detected
RBFOX2O43251 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47not detected
RBFOX2O43251 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.466e-7■■■■□ 23.5
RBFOX2O43251 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45not detected
RBFOX2O43251 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45not detected
RBFOX2O43251 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44not detected
RBFOX2O43251 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43not detected
RBFOX2O43251 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.432e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.423e-6■□□□□ 10.7
RBFOX2O43251 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42not detected
RBFOX2O43251 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42not detected
RBFOX2O43251 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41not detected
RBFOX2O43251 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41not detected
RBFOX2O43251 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41not detected
RBFOX2O43251 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 19.6
RBFOX2O43251 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41not detected
RBFOX2O43251 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.419e-7■■■□□ 15.9
RBFOX2O43251 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4not detected
RBFOX2O43251 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4not detected
RBFOX2O43251 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.393e-7■■■□□ 19.2
RBFOX2O43251 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.388e-8■■□□□ 12
RBFOX2O43251 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38not detected
RBFOX2O43251 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38not detected
RBFOX2O43251 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.388e-10■□□□□ 11.3
RBFOX2O43251 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38not detected
RBFOX2O43251 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38not detected
RBFOX2O43251 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37not detected
RBFOX2O43251 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.372e-10■■■□□ 18.4
RBFOX2O43251 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37not detected
RBFOX2O43251 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-6■■□□□ 13
RBFOX2O43251 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37not detected
RBFOX2O43251 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36not detected
RBFOX2O43251 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36not detected
RBFOX2O43251 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35not detected
RBFOX2O43251 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35not detected
RBFOX2O43251 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35not detected
RBFOX2O43251 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.358e-8■■□□□ 12
RBFOX2O43251 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35not detected
RBFOX2O43251 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 29.5
RBFOX2O43251 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34not detected
RBFOX2O43251 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34not detected
RBFOX2O43251 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 20.3
RBFOX2O43251 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34not detected
RBFOX2O43251 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34not detected
RBFOX2O43251 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.341e-6■■□□□ 14.1
RBFOX2O43251 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34not detected
RBFOX2O43251 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34not detected
RBFOX2O43251 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.5 ms