Protein–RNA interactions for Protein: O35664

Ifnar2, Interferon alpha/beta receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar2O35664 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Ifnar2O35664 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ifnar2O35664 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ifnar2O35664 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ifnar2O35664 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ifnar2O35664 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ifnar2O35664 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ifnar2O35664 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ifnar2O35664 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ifnar2O35664 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ifnar2O35664 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ifnar2O35664 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Ifnar2O35664 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ifnar2O35664 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ifnar2O35664 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ifnar2O35664 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ifnar2O35664 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ifnar2O35664 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Ifnar2O35664 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ifnar2O35664 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ifnar2O35664 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ifnar2O35664 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ifnar2O35664 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ifnar2O35664 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ifnar2O35664 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ifnar2O35664 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ifnar2O35664 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ifnar2O35664 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ifnar2O35664 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ifnar2O35664 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ifnar2O35664 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ifnar2O35664 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Ifnar2O35664 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ifnar2O35664 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ifnar2O35664 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ifnar2O35664 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ifnar2O35664 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ifnar2O35664 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ifnar2O35664 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ifnar2O35664 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ifnar2O35664 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ifnar2O35664 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ifnar2O35664 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ifnar2O35664 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ifnar2O35664 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ifnar2O35664 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ifnar2O35664 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ifnar2O35664 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ifnar2O35664 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ifnar2O35664 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ifnar2O35664 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ifnar2O35664 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ifnar2O35664 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ifnar2O35664 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ifnar2O35664 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ifnar2O35664 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ifnar2O35664 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ifnar2O35664 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ifnar2O35664 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ifnar2O35664 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ifnar2O35664 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ifnar2O35664 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ifnar2O35664 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ifnar2O35664 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ifnar2O35664 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ifnar2O35664 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ifnar2O35664 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ifnar2O35664 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ifnar2O35664 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ifnar2O35664 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ifnar2O35664 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ifnar2O35664 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ifnar2O35664 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ifnar2O35664 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ifnar2O35664 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ifnar2O35664 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ifnar2O35664 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ifnar2O35664 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ifnar2O35664 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ifnar2O35664 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ifnar2O35664 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ifnar2O35664 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ifnar2O35664 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ifnar2O35664 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ifnar2O35664 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ifnar2O35664 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ifnar2O35664 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ifnar2O35664 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ifnar2O35664 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ifnar2O35664 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ifnar2O35664 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ifnar2O35664 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ifnar2O35664 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ifnar2O35664 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ifnar2O35664 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ifnar2O35664 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ifnar2O35664 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ifnar2O35664 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ifnar2O35664 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ifnar2O35664 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms