Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GSC2O15499 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSC2O15499 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GSC2O15499 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSC2O15499 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GSC2O15499 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GSC2O15499 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSC2O15499 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GSC2O15499 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GSC2O15499 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GSC2O15499 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSC2O15499 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSC2O15499 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GSC2O15499 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSC2O15499 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSC2O15499 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSC2O15499 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSC2O15499 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSC2O15499 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSC2O15499 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSC2O15499 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSC2O15499 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSC2O15499 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GSC2O15499 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GSC2O15499 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GSC2O15499 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSC2O15499 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GSC2O15499 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSC2O15499 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GSC2O15499 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSC2O15499 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GSC2O15499 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GSC2O15499 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSC2O15499 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSC2O15499 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GSC2O15499 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSC2O15499 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSC2O15499 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSC2O15499 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GSC2O15499 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GSC2O15499 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSC2O15499 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSC2O15499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GSC2O15499 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSC2O15499 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GSC2O15499 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSC2O15499 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSC2O15499 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GSC2O15499 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GSC2O15499 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSC2O15499 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GSC2O15499 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSC2O15499 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSC2O15499 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSC2O15499 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSC2O15499 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSC2O15499 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSC2O15499 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSC2O15499 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSC2O15499 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSC2O15499 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSC2O15499 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSC2O15499 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSC2O15499 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSC2O15499 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GSC2O15499 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GSC2O15499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GSC2O15499 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSC2O15499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GSC2O15499 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GSC2O15499 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GSC2O15499 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSC2O15499 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GSC2O15499 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GSC2O15499 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GSC2O15499 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSC2O15499 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSC2O15499 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GSC2O15499 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSC2O15499 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSC2O15499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSC2O15499 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSC2O15499 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSC2O15499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSC2O15499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSC2O15499 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSC2O15499 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSC2O15499 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GSC2O15499 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSC2O15499 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GSC2O15499 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSC2O15499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GSC2O15499 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GSC2O15499 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSC2O15499 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSC2O15499 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSC2O15499 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSC2O15499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSC2O15499 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSC2O15499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms