Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SdcbpO08992 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SdcbpO08992 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SdcbpO08992 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SdcbpO08992 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SdcbpO08992 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SdcbpO08992 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SdcbpO08992 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SdcbpO08992 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SdcbpO08992 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SdcbpO08992 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SdcbpO08992 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SdcbpO08992 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SdcbpO08992 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SdcbpO08992 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SdcbpO08992 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SdcbpO08992 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SdcbpO08992 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SdcbpO08992 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SdcbpO08992 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdcbpO08992 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdcbpO08992 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SdcbpO08992 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdcbpO08992 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdcbpO08992 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SdcbpO08992 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SdcbpO08992 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SdcbpO08992 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SdcbpO08992 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SdcbpO08992 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SdcbpO08992 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SdcbpO08992 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SdcbpO08992 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SdcbpO08992 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SdcbpO08992 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SdcbpO08992 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SdcbpO08992 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdcbpO08992 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SdcbpO08992 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdcbpO08992 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdcbpO08992 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdcbpO08992 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdcbpO08992 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SdcbpO08992 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdcbpO08992 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SdcbpO08992 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SdcbpO08992 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SdcbpO08992 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdcbpO08992 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SdcbpO08992 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SdcbpO08992 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SdcbpO08992 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SdcbpO08992 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SdcbpO08992 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SdcbpO08992 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SdcbpO08992 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SdcbpO08992 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SdcbpO08992 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SdcbpO08992 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SdcbpO08992 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SdcbpO08992 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SdcbpO08992 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SdcbpO08992 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SdcbpO08992 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SdcbpO08992 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SdcbpO08992 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SdcbpO08992 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SdcbpO08992 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SdcbpO08992 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SdcbpO08992 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SdcbpO08992 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SdcbpO08992 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SdcbpO08992 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SdcbpO08992 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SdcbpO08992 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdcbpO08992 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdcbpO08992 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdcbpO08992 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SdcbpO08992 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SdcbpO08992 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdcbpO08992 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdcbpO08992 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SdcbpO08992 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdcbpO08992 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdcbpO08992 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdcbpO08992 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SdcbpO08992 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SdcbpO08992 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SdcbpO08992 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SdcbpO08992 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SdcbpO08992 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SdcbpO08992 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SdcbpO08992 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SdcbpO08992 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdcbpO08992 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdcbpO08992 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdcbpO08992 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdcbpO08992 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdcbpO08992 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdcbpO08992 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms