Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B8ZZF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B8ZZF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
B8ZZF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B8ZZF3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
B8ZZF3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B8ZZF3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B8ZZF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
B8ZZF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
B8ZZF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
B8ZZF3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
B8ZZF3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
B8ZZF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
B8ZZF3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
B8ZZF3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
B8ZZF3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
B8ZZF3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
B8ZZF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
B8ZZF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
B8ZZF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
B8ZZF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
B8ZZF3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
B8ZZF3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
B8ZZF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
B8ZZF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B8ZZF3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B8ZZF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
B8ZZF3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B8ZZF3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B8ZZF3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B8ZZF3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B8ZZF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B8ZZF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B8ZZF3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B8ZZF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
B8ZZF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
B8ZZF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B8ZZF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B8ZZF3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B8ZZF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
B8ZZF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
B8ZZF3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B8ZZF3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
B8ZZF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
B8ZZF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B8ZZF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B8ZZF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
B8ZZF3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B8ZZF3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
B8ZZF3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
B8ZZF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
B8ZZF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
B8ZZF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
B8ZZF3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
B8ZZF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
B8ZZF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
B8ZZF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
B8ZZF3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
B8ZZF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
B8ZZF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
B8ZZF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B8ZZF3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B8ZZF3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B8ZZF3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B8ZZF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B8ZZF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B8ZZF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
B8ZZF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
B8ZZF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
B8ZZF3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B8ZZF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B8ZZF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B8ZZF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
B8ZZF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B8ZZF3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B8ZZF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B8ZZF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
B8ZZF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
B8ZZF3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
B8ZZF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
B8ZZF3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
B8ZZF3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
B8ZZF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
B8ZZF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
B8ZZF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
B8ZZF3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
B8ZZF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
B8ZZF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
B8ZZF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
B8ZZF3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
B8ZZF3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B8ZZF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B8ZZF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B8ZZF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B8ZZF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
B8ZZF3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
B8ZZF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B8ZZF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B8ZZF3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B8ZZF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms