Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
Arid3cA6PWV5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Arid3cA6PWV5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Arid3cA6PWV5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Arid3cA6PWV5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
Arid3cA6PWV5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Arid3cA6PWV5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Arid3cA6PWV5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Arid3cA6PWV5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Arid3cA6PWV5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Arid3cA6PWV5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Arid3cA6PWV5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Arid3cA6PWV5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Arid3cA6PWV5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Arid3cA6PWV5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Arid3cA6PWV5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Arid3cA6PWV5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Arid3cA6PWV5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Arid3cA6PWV5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Arid3cA6PWV5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Arid3cA6PWV5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Arid3cA6PWV5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Arid3cA6PWV5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Arid3cA6PWV5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Arid3cA6PWV5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Arid3cA6PWV5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Arid3cA6PWV5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Arid3cA6PWV5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Arid3cA6PWV5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Arid3cA6PWV5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Arid3cA6PWV5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Arid3cA6PWV5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Arid3cA6PWV5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Arid3cA6PWV5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
Arid3cA6PWV5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Arid3cA6PWV5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Arid3cA6PWV5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Arid3cA6PWV5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Arid3cA6PWV5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Arid3cA6PWV5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Arid3cA6PWV5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Arid3cA6PWV5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Arid3cA6PWV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Arid3cA6PWV5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Arid3cA6PWV5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Arid3cA6PWV5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Arid3cA6PWV5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Arid3cA6PWV5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Arid3cA6PWV5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Arid3cA6PWV5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Arid3cA6PWV5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Arid3cA6PWV5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Arid3cA6PWV5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Arid3cA6PWV5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Arid3cA6PWV5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Arid3cA6PWV5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Arid3cA6PWV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Arid3cA6PWV5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Arid3cA6PWV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Arid3cA6PWV5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Arid3cA6PWV5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Arid3cA6PWV5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Arid3cA6PWV5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Arid3cA6PWV5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Arid3cA6PWV5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Arid3cA6PWV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
Arid3cA6PWV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Arid3cA6PWV5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Arid3cA6PWV5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Arid3cA6PWV5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Arid3cA6PWV5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Arid3cA6PWV5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Arid3cA6PWV5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Arid3cA6PWV5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Arid3cA6PWV5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Arid3cA6PWV5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Arid3cA6PWV5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Arid3cA6PWV5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Arid3cA6PWV5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Arid3cA6PWV5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Arid3cA6PWV5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Arid3cA6PWV5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Arid3cA6PWV5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Arid3cA6PWV5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Arid3cA6PWV5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arid3cA6PWV5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arid3cA6PWV5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms