Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Frmpd1A2AKB4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Frmpd1A2AKB4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC50.16■■■■■ 5.62
Frmpd1A2AKB4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
Frmpd1A2AKB4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
Frmpd1A2AKB4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
Frmpd1A2AKB4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
Frmpd1A2AKB4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Frmpd1A2AKB4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
Frmpd1A2AKB4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC49.82■■■■■ 5.57
Frmpd1A2AKB4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
Frmpd1A2AKB4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Frmpd1A2AKB4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Frmpd1A2AKB4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Frmpd1A2AKB4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
Frmpd1A2AKB4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
Frmpd1A2AKB4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
Frmpd1A2AKB4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
Frmpd1A2AKB4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
Frmpd1A2AKB4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
Frmpd1A2AKB4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC49.43■■■■■ 5.5
Frmpd1A2AKB4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC49.43■■■■■ 5.5
Frmpd1A2AKB4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Frmpd1A2AKB4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Frmpd1A2AKB4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Frmpd1A2AKB4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
Frmpd1A2AKB4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Frmpd1A2AKB4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
Frmpd1A2AKB4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
Frmpd1A2AKB4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC49.19■■■■■ 5.47
Frmpd1A2AKB4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
Frmpd1A2AKB4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
Frmpd1A2AKB4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Frmpd1A2AKB4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
Frmpd1A2AKB4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC49.09■■■■■ 5.45
Frmpd1A2AKB4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
Frmpd1A2AKB4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
Frmpd1A2AKB4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
Frmpd1A2AKB4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
Frmpd1A2AKB4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
Frmpd1A2AKB4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.42
Frmpd1A2AKB4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
Frmpd1A2AKB4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
Frmpd1A2AKB4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
Frmpd1A2AKB4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC48.69■■■■■ 5.39
Frmpd1A2AKB4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC48.63■■■■■ 5.38
Frmpd1A2AKB4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC48.62■■■■■ 5.37
Frmpd1A2AKB4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC48.62■■■■■ 5.37
Frmpd1A2AKB4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Frmpd1A2AKB4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
Frmpd1A2AKB4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Frmpd1A2AKB4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC48.53■■■■■ 5.36
Frmpd1A2AKB4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Frmpd1A2AKB4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.48■■■■■ 5.35
Frmpd1A2AKB4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.48■■■■■ 5.35
Frmpd1A2AKB4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
Frmpd1A2AKB4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
Frmpd1A2AKB4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
Frmpd1A2AKB4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC48.43■■■■■ 5.34
Frmpd1A2AKB4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.42■■■■■ 5.34
Frmpd1A2AKB4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
Frmpd1A2AKB4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
Frmpd1A2AKB4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Frmpd1A2AKB4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC48.31■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC48.29■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.32
Frmpd1A2AKB4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Frmpd1A2AKB4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.3
Frmpd1A2AKB4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC48.12■■■■■ 5.29
Frmpd1A2AKB4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Frmpd1A2AKB4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC48.09■■■■■ 5.29
Frmpd1A2AKB4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Frmpd1A2AKB4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
Frmpd1A2AKB4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC48.03■■■■■ 5.28
Frmpd1A2AKB4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC48.02■■■■■ 5.28
Frmpd1A2AKB4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
Frmpd1A2AKB4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC47.97■■■■■ 5.27
Frmpd1A2AKB4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Frmpd1A2AKB4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC47.96■■■■■ 5.27
Frmpd1A2AKB4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Frmpd1A2AKB4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Frmpd1A2AKB4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
Frmpd1A2AKB4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Frmpd1A2AKB4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Frmpd1A2AKB4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Frmpd1A2AKB4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Frmpd1A2AKB4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Frmpd1A2AKB4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Frmpd1A2AKB4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
Frmpd1A2AKB4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Frmpd1A2AKB4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
Frmpd1A2AKB4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Frmpd1A2AKB4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
Frmpd1A2AKB4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms