Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Camsap1A2AHC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
Camsap1A2AHC3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Camsap1A2AHC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Camsap1A2AHC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Camsap1A2AHC3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Camsap1A2AHC3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
Camsap1A2AHC3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Camsap1A2AHC3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Camsap1A2AHC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Camsap1A2AHC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Camsap1A2AHC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Camsap1A2AHC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
Camsap1A2AHC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
Camsap1A2AHC3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Camsap1A2AHC3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Camsap1A2AHC3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Camsap1A2AHC3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
Camsap1A2AHC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Camsap1A2AHC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Camsap1A2AHC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
Camsap1A2AHC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Camsap1A2AHC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Camsap1A2AHC3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Camsap1A2AHC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Camsap1A2AHC3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
Camsap1A2AHC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Camsap1A2AHC3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Camsap1A2AHC3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
Camsap1A2AHC3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Camsap1A2AHC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Camsap1A2AHC3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Camsap1A2AHC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Camsap1A2AHC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
Camsap1A2AHC3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Camsap1A2AHC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Camsap1A2AHC3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Camsap1A2AHC3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.29■■■■■ 5
Camsap1A2AHC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Camsap1A2AHC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Camsap1A2AHC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
Camsap1A2AHC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Camsap1A2AHC3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Camsap1A2AHC3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Camsap1A2AHC3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Camsap1A2AHC3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Camsap1A2AHC3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Camsap1A2AHC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
Camsap1A2AHC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Camsap1A2AHC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Camsap1A2AHC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Camsap1A2AHC3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
Camsap1A2AHC3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Camsap1A2AHC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Camsap1A2AHC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Camsap1A2AHC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Camsap1A2AHC3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Camsap1A2AHC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
Camsap1A2AHC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
Camsap1A2AHC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Camsap1A2AHC3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Camsap1A2AHC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Camsap1A2AHC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Camsap1A2AHC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
Camsap1A2AHC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Camsap1A2AHC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
Camsap1A2AHC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Camsap1A2AHC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Camsap1A2AHC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Camsap1A2AHC3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Camsap1A2AHC3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Camsap1A2AHC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Camsap1A2AHC3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Camsap1A2AHC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Camsap1A2AHC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC45.4■■■■■ 4.86
Camsap1A2AHC3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Camsap1A2AHC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
Camsap1A2AHC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Camsap1A2AHC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Camsap1A2AHC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Camsap1A2AHC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Camsap1A2AHC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
Camsap1A2AHC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
Camsap1A2AHC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Camsap1A2AHC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
Camsap1A2AHC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Camsap1A2AHC3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Camsap1A2AHC3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Camsap1A2AHC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Camsap1A2AHC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Camsap1A2AHC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
Camsap1A2AHC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Camsap1A2AHC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Camsap1A2AHC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Camsap1A2AHC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Camsap1A2AHC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Camsap1A2AHC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Camsap1A2AHC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Camsap1A2AHC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Camsap1A2AHC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms