Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GV50

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GV50 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GV50 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GV50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GV50 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GV50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GV50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GV50 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GV50 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GV50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GV50 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GV50 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GV50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1B0GV50 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1B0GV50 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1B0GV50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GV50 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GV50 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GV50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.2 ms