Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LJ72

Muc16, Mucin 16, mousemouse

Predictions only

Length 8,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc16A0A140LJ72 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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