Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
RABGEF1Q9UJ41 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
RABGEF1Q9UJ41 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
RABGEF1Q9UJ41 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
RABGEF1Q9UJ41 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 488.4 ms