Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
KNOP1Q1ED39 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
KNOP1Q1ED39 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
KNOP1Q1ED39 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
KNOP1Q1ED39 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
KNOP1Q1ED39 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
KNOP1Q1ED39 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
KNOP1Q1ED39 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.75□□□□□ -3.17
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
KNOP1Q1ED39 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.8 ms