Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CCDC142Q17RM4 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CCDC142Q17RM4 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CCDC142Q17RM4 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CCDC142Q17RM4 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CCDC142Q17RM4 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CCDC142Q17RM4 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CCDC142Q17RM4 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CCDC142Q17RM4 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.6 ms