Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RAPGEF1Q13905 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RAPGEF1Q13905 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
RAPGEF1Q13905 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
RAPGEF1Q13905 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
RAPGEF1Q13905 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RAPGEF1Q13905 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RAPGEF1Q13905 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
RAPGEF1Q13905 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
RAPGEF1Q13905 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
RAPGEF1Q13905 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
RAPGEF1Q13905 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
RAPGEF1Q13905 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
RAPGEF1Q13905 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
RAPGEF1Q13905 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.6 ms