Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
SPTAN1Q13813 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
SPTAN1Q13813 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
SPTAN1Q13813 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
SPTAN1Q13813 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
SPTAN1Q13813 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-6.07□□□□□ -3.38
SPTAN1Q13813 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
SPTAN1Q13813 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-6.14□□□□□ -3.39
SPTAN1Q13813 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-6.15□□□□□ -3.39
SPTAN1Q13813 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-6.15□□□□□ -3.39
SPTAN1Q13813 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-6.2□□□□□ -3.4
SPTAN1Q13813 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.41
SPTAN1Q13813 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-6.34□□□□□ -3.42
SPTAN1Q13813 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-6.37□□□□□ -3.43
SPTAN1Q13813 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
SPTAN1Q13813 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-6.72□□□□□ -3.48
SPTAN1Q13813 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-6.98□□□□□ -3.53
SPTAN1Q13813 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.55
SPTAN1Q13813 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-7.16□□□□□ -3.55
SPTAN1Q13813 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-7.26□□□□□ -3.57
SPTAN1Q13813 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
SPTAN1Q13813 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-7.49□□□□□ -3.61
SPTAN1Q13813 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-7.53□□□□□ -3.62
SPTAN1Q13813 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-7.67□□□□□ -3.64
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 2.7 ms