Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.76□□□□□ -3.17
SNX1Q13596 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-4.77□□□□□ -3.17
SNX1Q13596 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.78□□□□□ -3.17
SNX1Q13596 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.85□□□□□ -3.19
SNX1Q13596 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
SNX1Q13596 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
SNX1Q13596 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
SNX1Q13596 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
SNX1Q13596 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
SNX1Q13596 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
SNX1Q13596 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
SNX1Q13596 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
SNX1Q13596 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
SNX1Q13596 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-5.37□□□□□ -3.27
SNX1Q13596 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
SNX1Q13596 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
SNX1Q13596 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
SNX1Q13596 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
SNX1Q13596 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
SNX1Q13596 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
SNX1Q13596 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
SNX1Q13596 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
SNX1Q13596 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-6.09□□□□□ -3.38
SNX1Q13596 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 5.4 ms