Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
HDAC1Q13547 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HDAC1Q13547 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HDAC1Q13547 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
HDAC1Q13547 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HDAC1Q13547 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HDAC1Q13547 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HDAC1Q13547 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HDAC1Q13547 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HDAC1Q13547 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HDAC1Q13547 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HDAC1Q13547 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HDAC1Q13547 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HDAC1Q13547 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HDAC1Q13547 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HDAC1Q13547 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HDAC1Q13547 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HDAC1Q13547 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
HDAC1Q13547 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
HDAC1Q13547 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
HDAC1Q13547 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
HDAC1Q13547 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 5.7 ms