Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PGGT1BP53609 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PGGT1BP53609 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PGGT1BP53609 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PGGT1BP53609 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PGGT1BP53609 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PGGT1BP53609 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
PGGT1BP53609 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PGGT1BP53609 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PGGT1BP53609 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PGGT1BP53609 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PGGT1BP53609 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PGGT1BP53609 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PGGT1BP53609 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PGGT1BP53609 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PGGT1BP53609 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
PGGT1BP53609 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PGGT1BP53609 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
PGGT1BP53609 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
PGGT1BP53609 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 4.2 ms