Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
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TRIM4Q9C037 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
TRIM4Q9C037 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
TRIM4Q9C037 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.13□□□□□ -3.07
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TRIM4Q9C037 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
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TRIM4Q9C037 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
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TRIM4Q9C037 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
TRIM4Q9C037 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
TRIM4Q9C037 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
TRIM4Q9C037 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
TRIM4Q9C037 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
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TRIM4Q9C037 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
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TRIM4Q9C037 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
TRIM4Q9C037 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
TRIM4Q9C037 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
TRIM4Q9C037 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
TRIM4Q9C037 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
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TRIM4Q9C037 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
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TRIM4Q9C037 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
TRIM4Q9C037 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
TRIM4Q9C037 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
TRIM4Q9C037 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
TRIM4Q9C037 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
TRIM4Q9C037 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.04□□□□□ -3.22
TRIM4Q9C037 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
TRIM4Q9C037 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TRIM4Q9C037 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
TRIM4Q9C037 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
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