Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-6.84□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-6.84□□□□□ -3.5
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-6.85□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-6.86□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-6.87□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-6.88□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-6.9□□□□□ -3.51
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-6.92□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-6.93□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-6.93□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-6.93□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-6.94□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-6.95□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-6.96□□□□□ -3.52
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-6.98□□□□□ -3.53
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-6.98□□□□□ -3.53
NRXN3Q9Y4C0 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-6.99□□□□□ -3.53
NRXN3Q9Y4C0 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-7.01□□□□□ -3.53
NRXN3Q9Y4C0 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-7.01□□□□□ -3.53
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-7.05□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-7.05□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-7.09□□□□□ -3.54
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-7.1□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-7.1□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-7.11□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-7.13□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-7.15□□□□□ -3.55
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-7.16□□□□□ -3.56
NRXN3Q9Y4C0 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-7.17□□□□□ -3.56
NRXN3Q9Y4C0 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-7.17□□□□□ -3.56
NRXN3Q9Y4C0 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
NRXN3Q9Y4C0 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-7.19□□□□□ -3.56
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-7.23□□□□□ -3.57
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-7.26□□□□□ -3.57
NRXN3Q9Y4C0 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-7.26□□□□□ -3.57
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-7.27□□□□□ -3.57
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-7.3□□□□□ -3.58
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-7.3□□□□□ -3.58
NRXN3Q9Y4C0 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-7.31□□□□□ -3.58
NRXN3Q9Y4C0 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-7.32□□□□□ -3.58
NRXN3Q9Y4C0 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-7.36□□□□□ -3.59
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-7.37□□□□□ -3.59
NRXN3Q9Y4C0 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-7.37□□□□□ -3.59
NRXN3Q9Y4C0 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-7.38□□□□□ -3.59
NRXN3Q9Y4C0 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-7.38□□□□□ -3.59
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-7.41□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-7.41□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-7.43□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-7.45□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-7.45□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-7.47□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-7.47□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-7.48□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-7.49□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-7.49□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-7.5□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-7.52□□□□□ -3.61
NRXN3Q9Y4C0 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-7.53□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-7.54□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-7.55□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-7.56□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-7.56□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-7.56□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-7.56□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-7.56□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-7.57□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-7.57□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-7.59□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-7.59□□□□□ -3.62
NRXN3Q9Y4C0 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-7.6□□□□□ -3.63
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-7.6□□□□□ -3.63
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-7.6□□□□□ -3.63
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-7.6□□□□□ -3.63
NRXN3Q9Y4C0 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-7.61□□□□□ -3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms