Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
VAX2Q9UIW0 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
VAX2Q9UIW0 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
VAX2Q9UIW0 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAX2Q9UIW0 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.8 ms