Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
TRIM4Q9C037 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRIM4Q9C037 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRIM4Q9C037 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRIM4Q9C037 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRIM4Q9C037 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
TRIM4Q9C037 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
TRIM4Q9C037 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
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TRIM4Q9C037 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
TRIM4Q9C037 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
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TRIM4Q9C037 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
TRIM4Q9C037 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.96□□□□□ -3.04
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TRIM4Q9C037 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
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TRIM4Q9C037 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
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TRIM4Q9C037 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
TRIM4Q9C037 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
TRIM4Q9C037 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
TRIM4Q9C037 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
TRIM4Q9C037 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
TRIM4Q9C037 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
TRIM4Q9C037 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
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