Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
MEIS3Q99687 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
MEIS3Q99687 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS3Q99687 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
MEIS3Q99687 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MEIS3Q99687 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MEIS3Q99687 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MEIS3Q99687 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS3Q99687 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms