Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
LONRF1Q17RB8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
LONRF1Q17RB8 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LONRF1Q17RB8 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
LONRF1Q17RB8 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
LONRF1Q17RB8 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
LONRF1Q17RB8 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms