Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
E2F4Q16254 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
E2F4Q16254 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
E2F4Q16254 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
E2F4Q16254 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
E2F4Q16254 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
E2F4Q16254 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
E2F4Q16254 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
E2F4Q16254 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
E2F4Q16254 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
E2F4Q16254 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
E2F4Q16254 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
E2F4Q16254 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
E2F4Q16254 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
E2F4Q16254 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
E2F4Q16254 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
E2F4Q16254 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
E2F4Q16254 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
E2F4Q16254 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
E2F4Q16254 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
E2F4Q16254 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
E2F4Q16254 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
E2F4Q16254 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
E2F4Q16254 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
E2F4Q16254 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
E2F4Q16254 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
E2F4Q16254 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
E2F4Q16254 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
E2F4Q16254 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
E2F4Q16254 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
E2F4Q16254 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
E2F4Q16254 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
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