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Protein–RNA interactions for Protein: Q13619
CUL4A, Cullin-4A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4A
Q13619
RNU6-649P-201
ENST00000384463
107 nt
BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-2.76
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNU4-88P-201
ENST00000411220
86 nt
BASIC
-2.77
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNY3P8-201
ENST00000411366
126 nt
BASIC
-2.77
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-2.78
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
104 nt
BASIC
-2.78
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNU6-520P-201
ENST00000384717
104 nt
BASIC
-2.79
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
SNORD54-201
ENST00000459159
67 nt
BASIC
-2.79
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
RNU7-119P-201
ENST00000459279
63 nt
BASIC
-2.79
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
SNORA40B-201
ENST00000385573
128 nt
BASIC
-2.8
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
RNU6-539P-201
ENST00000516665
103 nt
BASIC
-2.8
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
U6.97-201
ENST00000636904
101 nt
BASIC
-2.8
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
RNU6-1206P-201
ENST00000516339
103 nt
BASIC
-2.81
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
U6.111-201
ENST00000636093
83 nt
BASIC
-2.81
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
RNU6-1255P-201
ENST00000363434
112 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
Y_RNA.388-201
ENST00000383919
113 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
MIR4511-201
ENST00000582784
87 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
AC103706.3-201
ENST00000636297
85 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
MIR4679-1-201
ENST00000637619
75 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
MIR548W-201
ENST00000581970
74 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
CUL4A
Q13619
RNU6-940P-201
ENST00000363433
104 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
MIR466-201
ENST00000580653
84 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
SNORD60-201
ENST00000383903
83 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
SNORD78.1-201
ENST00000390866
65 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
127 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
snoU13.10-201
ENST00000459301
103 nt
BASIC
-2.89
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
Y_RNA.228-201
ENST00000364346
98 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
SNORA40.16-201
ENST00000517238
121 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
CUL4A
Q13619
Y_RNA.43-201
ENST00000362670
111 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
SNORD45.2-201
ENST00000363552
72 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
hsa-mir-4773-1.1-201
ENST00000585225
78 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
MIR581-201
ENST00000384895
96 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-2.95
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
MIR1302-4-201
ENST00000408701
150 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
RNA5SP225-201
ENST00000410874
135 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
MIR548N-201
ENST00000408742
75 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
CUL4A
Q13619
RNU6-1296P-201
ENST00000383879
107 nt
BASIC
-2.98
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
RNU6-800P-201
ENST00000384473
103 nt
BASIC
-2.98
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
MIR3938-201
ENST00000582157
103 nt
BASIC
-2.98
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
SNORA17.4-201
ENST00000391287
132 nt
BASIC
-2.99
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
Y_RNA.565-201
ENST00000384719
101 nt
BASIC
-3
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
RNU6-530P-201
ENST00000391180
107 nt
BASIC
-3
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
MIR4662A-201
ENST00000637499
67 nt
BASIC
-3
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
Y_RNA.53-201
ENST00000362765
102 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
RNU6-361P-201
ENST00000364454
107 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
Y_RNA.403-201
ENST00000383977
101 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
AL451105.1-201
ENST00000450005
189 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
RNA5SP93-201
ENST00000362525
114 nt
BASIC
-3.02
□□□□□ -2.89
CUL4A
Q13619
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-3.04
□□□□□ -2.9
CUL4A
Q13619
RNU6-776P-201
ENST00000364403
104 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
CUL4A
Q13619
RNU6-1022P-201
ENST00000365049
104 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
CUL4A
Q13619
Y_RNA.349-201
ENST00000365406
102 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
CUL4A
Q13619
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
CUL4A
Q13619
RNY4P7-201
ENST00000364600
96 nt
BASIC
-3.08
□□□□□ -2.9
CUL4A
Q13619
TRGJP-201
ENST00000390338
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-3.11
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
AC110620.1-201
ENST00000416042
228 nt
BASIC
-3.11
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
RNY4P9-201
ENST00000363194
97 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.647-201
ENST00000459194
112 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.640-201
ENST00000459296
112 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.803-201
ENST00000614432
112 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.815-201
ENST00000616655
112 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.795-201
ENST00000619475
112 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.827-201
ENST00000638104
112 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
MIR4426-201
ENST00000640330
63 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
101 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
RNU6-419P-201
ENST00000517030
63 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
CUL4A
Q13619
TRAJ33-201
ENST00000390504
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-3.16
□□□□□ -2.92
CUL4A
Q13619
RNU6-68P-201
ENST00000516576
104 nt
BASIC
-3.16
□□□□□ -2.92
CUL4A
Q13619
RNU6-176P-201
ENST00000517196
105 nt
BASIC
-3.19
□□□□□ -2.92
CUL4A
Q13619
MIR379-201
ENST00000362218
67 nt
BASIC
-3.2
□□□□□ -2.92
CUL4A
Q13619
RNU6-300P-201
ENST00000459080
104 nt
BASIC
-3.2
□□□□□ -2.92
CUL4A
Q13619
Y_RNA.685-201
ENST00000516532
108 nt
BASIC
-3.2
□□□□□ -2.92
CUL4A
Q13619
SNORD113-3-201
ENST00000364830
72 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
SMAD5-AS1_3.1-201
ENST00000614187
124 nt
BASIC
-3.23
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
RNU6-471P-201
ENST00000383944
106 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
RNU6-1324P-201
ENST00000384222
107 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
ZEB2_AS1_4.1-201
ENST00000615159
78 nt
BASIC
-3.24
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
RNU6-590P-201
ENST00000365039
107 nt
BASIC
-3.25
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
RNU6-1191P-201
ENST00000516799
107 nt
BASIC
-3.25
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
Y_RNA.386-201
ENST00000383913
105 nt
BASIC
-3.26
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
Y_RNA.513-201
ENST00000384522
100 nt
BASIC
-3.26
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
Y_RNA.129-201
ENST00000363392
110 nt
BASIC
-3.27
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
MIR548AJ2-201
ENST00000408539
92 nt
BASIC
-3.28
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
AC114801.3-201
ENST00000510231
177 nt
BASIC
-3.28
□□□□□ -2.93
CUL4A
Q13619
Y_RNA.519-201
ENST00000384553
102 nt
BASIC
-3.29
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
RNU6-912P-201
ENST00000363800
104 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
RNU6-1047P-201
ENST00000364418
107 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
RNU6-1079P-201
ENST00000362861
110 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
Y_RNA.204-201
ENST00000364112
102 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
RNU6-141P-201
ENST00000410499
105 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
SNX3P1Y-201
ENST00000615757
176 nt
BASIC
-3.31
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
RNU6-230P-201
ENST00000362457
104 nt
BASIC
-3.34
□□□□□ -2.94
CUL4A
Q13619
Y_RNA.186-201
ENST00000363899
92 nt
BASIC
-3.34
□□□□□ -2.94
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