Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CHD3Q12873 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
CHD3Q12873 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CHD3Q12873 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CHD3Q12873 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
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