Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
MEIS1O00470 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
MEIS1O00470 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
MEIS1O00470 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MEIS1O00470 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MEIS1O00470 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
MEIS1O00470 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
MEIS1O00470 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
MEIS1O00470 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
MEIS1O00470 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301 ms