Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
GPA33Q99795 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
GPA33Q99795 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
GPA33Q99795 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
GPA33Q99795 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.1 ms