Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ZBED3Q96IU2 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ZBED3Q96IU2 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ZBED3Q96IU2 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ZBED3Q96IU2 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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