Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATG4CQ96DT6 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ATG4CQ96DT6 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATG4CQ96DT6 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATG4CQ96DT6 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATG4CQ96DT6 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATG4CQ96DT6 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
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ATG4CQ96DT6 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
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ATG4CQ96DT6 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATG4CQ96DT6 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ATG4CQ96DT6 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATG4CQ96DT6 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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ATG4CQ96DT6 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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ATG4CQ96DT6 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ATG4CQ96DT6 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATG4CQ96DT6 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATG4CQ96DT6 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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