Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
FAM3DQ96BQ1 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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FAM3DQ96BQ1 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
FAM3DQ96BQ1 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
FAM3DQ96BQ1 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
FAM3DQ96BQ1 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
FAM3DQ96BQ1 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
FAM3DQ96BQ1 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
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FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
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FAM3DQ96BQ1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
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FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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FAM3DQ96BQ1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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