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Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1
FAM3D, Protein FAM3D, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
Length
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Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-44P-201
ENST00000384045
107 nt
BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
FAM3D
Q96BQ1
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
FAM3D
Q96BQ1
RNU4-88P-201
ENST00000411220
86 nt
BASIC
-2.14
□□□□□ -2.75
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1034P-201
ENST00000365335
101 nt
BASIC
-2.15
□□□□□ -2.75
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-789P-201
ENST00000517105
102 nt
BASIC
-2.16
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
-2.16
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.457-201
ENST00000384237
111 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-542P-201
ENST00000516405
103 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR198-201
ENST00000637333
62 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.291-201
ENST00000364886
113 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR548AI-201
ENST00000579940
88 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
104 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
AC013734.1-201
ENST00000619329
111 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR494-201
ENST00000349529
81 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-194P-201
ENST00000363862
105 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNY4P30-201
ENST00000410216
95 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP476-201
ENST00000516613
103 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR4666B-201
ENST00000578142
81 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1276P-201
ENST00000365372
104 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-242P-201
ENST00000384359
107 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR601-201
ENST00000385256
79 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
MIR1468-201
ENST00000410600
86 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
RNU6ATAC17P-201
ENST00000516074
71 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-974P-201
ENST00000384099
108 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
AL603908.1-201
ENST00000406098
201 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
SNX3P1X-201
ENST00000414887
175 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNU7-160P-201
ENST00000516660
62 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
SNORD19B.1-201
ENST00000630615
80 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.139-201
ENST00000363464
102 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
MIR450A2-201
ENST00000385022
100 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNY3P8-201
ENST00000411366
126 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
HAR1A.1-201
ENST00000459583
118 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
SNORD60.1-201
ENST00000362451
73 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-118P-201
ENST00000516552
102 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-153P-201
ENST00000364422
104 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-787P-201
ENST00000384032
107 nt
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-411P-201
ENST00000384451
107 nt
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
snoU13.10-201
ENST00000459301
103 nt
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
MIR548W-201
ENST00000581970
74 nt
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
U6.97-201
ENST00000636904
101 nt
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.69-201
ENST00000362885
109 nt
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-406P-201
ENST00000516470
107 nt
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1015P-201
ENST00000517121
99 nt
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
hsa-mir-4773-1.1-201
ENST00000585225
78 nt
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
MIR7110-201
ENST00000612638
86 nt
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
127 nt
BASIC
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□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-294P-201
ENST00000364999
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BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-231P-201
ENST00000517122
103 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
MIR466-201
ENST00000580653
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BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-828P-201
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BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.443-201
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BASIC
-2.32
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FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.694-201
ENST00000516677
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BASIC
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□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.55-201
ENST00000362797
102 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.178-201
ENST00000363832
102 nt
BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-810P-201
ENST00000364001
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BASIC
-2.34
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-634P-201
ENST00000459134
106 nt
BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-520P-201
ENST00000384717
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
U7.4-201
ENST00000614961
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BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-2.36
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-663P-201
ENST00000391105
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BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
SNORD116.2-201
ENST00000391251
93 nt
BASIC
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□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-820P-201
ENST00000384273
107 nt
BASIC
-2.38
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1206P-201
ENST00000516339
103 nt
BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1247P-201
ENST00000516622
98 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
FTX_4.1-201
ENST00000616291
147 nt
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-2.39
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.501-201
ENST00000384467
103 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
FAM3D
Q96BQ1
SNORA25.5-201
ENST00000363782
126 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.413-201
ENST00000384007
102 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
SNORA40B-201
ENST00000385573
128 nt
BASIC
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□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.754-201
ENST00000476024
102 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-2.41
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
SNORD60-201
ENST00000383903
83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-649P-201
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BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
MIR581-201
ENST00000384895
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BASIC
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□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
MIR5582-201
ENST00000579697
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BASIC
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□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
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ENST00000605302
128 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
RNY4P27-201
ENST00000363341
96 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
SNORA25.4-201
ENST00000363666
124 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
AC097484.2-201
ENST00000509147
251 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
-2.44
□□□□□ -2.8
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