Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
DDX54Q8TDD1 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
DDX54Q8TDD1 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
DDX54Q8TDD1 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX54Q8TDD1 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX54Q8TDD1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX54Q8TDD1 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX54Q8TDD1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
DDX54Q8TDD1 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
DDX54Q8TDD1 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX54Q8TDD1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX54Q8TDD1 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX54Q8TDD1 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms