Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
FXNQ16595 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FXNQ16595 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FXNQ16595 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
FXNQ16595 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
FXNQ16595 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
FXNQ16595 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
FXNQ16595 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
FXNQ16595 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
FXNQ16595 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
FXNQ16595 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
FXNQ16595 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
FXNQ16595 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
FXNQ16595 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
FXNQ16595 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
FXNQ16595 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
FXNQ16595 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
FXNQ16595 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
FXNQ16595 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
FXNQ16595 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FXNQ16595 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
FXNQ16595 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
FXNQ16595 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
FXNQ16595 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
FXNQ16595 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
FXNQ16595 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FXNQ16595 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FXNQ16595 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FXNQ16595 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
FXNQ16595 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
FXNQ16595 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
FXNQ16595 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
FXNQ16595 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
FXNQ16595 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
FXNQ16595 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FXNQ16595 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
FXNQ16595 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FXNQ16595 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FXNQ16595 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FXNQ16595 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
FXNQ16595 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
FXNQ16595 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
FXNQ16595 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
FXNQ16595 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
FXNQ16595 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
FXNQ16595 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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FXNQ16595 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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FXNQ16595 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
FXNQ16595 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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FXNQ16595 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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FXNQ16595 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
FXNQ16595 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
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FXNQ16595 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
FXNQ16595 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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FXNQ16595 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
FXNQ16595 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
FXNQ16595 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
FXNQ16595 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
FXNQ16595 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
FXNQ16595 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
FXNQ16595 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
FXNQ16595 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
FXNQ16595 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
FXNQ16595 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
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