Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF1Q15637 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF1Q15637 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SF1Q15637 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SF1Q15637 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SF1Q15637 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SF1Q15637 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SF1Q15637 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SF1Q15637 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SF1Q15637 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SF1Q15637 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF1Q15637 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF1Q15637 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SF1Q15637 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SF1Q15637 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SF1Q15637 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SF1Q15637 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SF1Q15637 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF1Q15637 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF1Q15637 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SF1Q15637 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SF1Q15637 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SF1Q15637 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SF1Q15637 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SF1Q15637 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SF1Q15637 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SF1Q15637 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SF1Q15637 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF1Q15637 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF1Q15637 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF1Q15637 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF1Q15637 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SF1Q15637 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SF1Q15637 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF1Q15637 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF1Q15637 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF1Q15637 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SF1Q15637 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SF1Q15637 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SF1Q15637 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SF1Q15637 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SF1Q15637 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SF1Q15637 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SF1Q15637 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SF1Q15637 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SF1Q15637 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SF1Q15637 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF1Q15637 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF1Q15637 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF1Q15637 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SF1Q15637 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SF1Q15637 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SF1Q15637 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SF1Q15637 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SF1Q15637 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SF1Q15637 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SF1Q15637 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SF1Q15637 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF1Q15637 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF1Q15637 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF1Q15637 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF1Q15637 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF1Q15637 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF1Q15637 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF1Q15637 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF1Q15637 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF1Q15637 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SF1Q15637 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms