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Protein–RNA interactions for Protein: Q13619
CUL4A, Cullin-4A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4A
Q13619
RNU6-995P-201
ENST00000391244
107 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
CUL4A
Q13619
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
CUL4A
Q13619
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
CUL4A
Q13619
Y_RNA.788-201
ENST00000622394
112 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
CUL4A
Q13619
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
CUL4A
Q13619
SNORD115-31-201
ENST00000365318
82 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
CUL4A
Q13619
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
RNU6-542P-201
ENST00000516405
103 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
MIR5582-201
ENST00000579697
68 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
Y_RNA.678-201
ENST00000516408
96 nt
BASIC
-2.36
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
RNU6-411P-201
ENST00000384451
107 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-2.37
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
RNY4P27-201
ENST00000363341
96 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
Y_RNA.175-201
ENST00000363794
111 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
Y_RNA.699-201
ENST00000516803
93 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
CUL4A
Q13619
RNU6-787P-201
ENST00000384032
107 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
Y_RNA.502-201
ENST00000384478
113 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
RNU6-172P-201
ENST00000411000
93 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
RNU7-151P-201
ENST00000516930
53 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
U7.4-201
ENST00000614961
63 nt
BASIC
-2.42
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
Y_RNA.81-201
ENST00000362997
102 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
MIR487B-201
ENST00000385021
84 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
-2.43
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
RNU6-695P-201
ENST00000391157
104 nt
BASIC
-2.44
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
RNU6-228P-201
ENST00000362700
106 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
AC108019.1-201
ENST00000512540
175 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
AC062037.1-201
ENST00000605302
128 nt
BASIC
-2.46
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
RNU6-1015P-201
ENST00000517121
99 nt
BASIC
-2.47
□□□□□ -2.8
CUL4A
Q13619
Y_RNA.103-201
ENST00000363171
102 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
MIR579-201
ENST00000385221
98 nt
BASIC
-2.48
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
AC120024.2-201
ENST00000576526
175 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
SNORD63.2-201
ENST00000516303
64 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
MIR664B-201
ENST00000626756
61 nt
BASIC
-2.51
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
RNU6-563P-201
ENST00000364872
108 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
RNU6-634P-201
ENST00000459134
106 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
Y_RNA.443-201
ENST00000384135
111 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
RNU6-258P-201
ENST00000390884
101 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
Y_RNA.781-201
ENST00000620301
103 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
CUL4A
Q13619
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
RNU6-669P-201
ENST00000365575
107 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
RNU6-841P-201
ENST00000383872
107 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
MIR3123-201
ENST00000583417
75 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
ST7-OT3_1.1-201
ENST00000619607
74 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
MIR3202-2-201
ENST00000635980
79 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
RNU6-663P-201
ENST00000391105
106 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
hsa-mir-4536-1.1-201
ENST00000636519
88 nt
BASIC
-2.55
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
RNU6-1247P-201
ENST00000516622
98 nt
BASIC
-2.56
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
MTRNR2L9-201
ENST00000622562
75 nt
BASIC
-2.56
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
SNORD60.1-201
ENST00000362451
73 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
MIR4756-201
ENST00000577874
78 nt
BASIC
-2.57
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
RNU7-160P-201
ENST00000516660
62 nt
BASIC
-2.59
□□□□□ -2.82
CUL4A
Q13619
Y_RNA.545-201
ENST00000384652
105 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
RNA5SP170-201
ENST00000517150
101 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
MIR7110-201
ENST00000612638
86 nt
BASIC
-2.6
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
Y_RNA.449-201
ENST00000384187
102 nt
BASIC
-2.61
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-2.61
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
Y_RNA.284-201
ENST00000364806
102 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
MIR548AM-201
ENST00000584298
74 nt
BASIC
-2.62
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-2.63
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
LINC01984-201
ENST00000583863
301 nt
TSL 3
BASIC
-2.63
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
RNU6-871P-201
ENST00000516122
100 nt
BASIC
-2.64
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
RNU6-118P-201
ENST00000516552
102 nt
BASIC
-2.64
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
SNORA25.4-201
ENST00000363666
124 nt
BASIC
-2.65
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
RNU6-980P-201
ENST00000516925
103 nt
BASIC
-2.65
□□□□□ -2.83
CUL4A
Q13619
SNORD73B-201
ENST00000364394
72 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-1034P-201
ENST00000365335
101 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
SNORD30.1-201
ENST00000391309
70 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
Y_RNA.684-201
ENST00000516510
99 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-231P-201
ENST00000517122
103 nt
BASIC
-2.66
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
Y_RNA.139-201
ENST00000363464
102 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
SNORA25.5-201
ENST00000363782
126 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-828P-201
ENST00000364876
107 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-1124P-201
ENST00000384169
107 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-2.69
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
Y_RNA.69-201
ENST00000362885
109 nt
BASIC
-2.7
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
SNORD116.2-201
ENST00000391251
93 nt
BASIC
-2.7
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
AC013734.1-201
ENST00000619329
111 nt
BASIC
-2.7
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-1298P-201
ENST00000362456
101 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
SNORA26.2-201
ENST00000390922
122 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-810P-201
ENST00000364001
107 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-857P-201
ENST00000515893
110 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
-2.72
□□□□□ -2.84
CUL4A
Q13619
MIR1255A-201
ENST00000408338
113 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNY4P29-201
ENST00000410801
97 nt
BASIC
-2.74
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNU6-194P-201
ENST00000363862
105 nt
BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNU6-573P-201
ENST00000383938
106 nt
BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNU6-974P-201
ENST00000384099
108 nt
BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
RNU6-279P-201
ENST00000391297
101 nt
BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
CUL4A
Q13619
SNORD19B.1-201
ENST00000630615
80 nt
BASIC
-2.75
□□□□□ -2.85
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