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Protein–RNA interactions for Protein: Q13618
CUL3, Cullin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL3
Q13618
RNU6-1267P-201
ENST00000410747
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
U4.2-201
ENST00000618561
85 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
MIR487B-201
ENST00000385021
84 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-1111P-201
ENST00000391118
107 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
Y_RNA.603-201
ENST00000410571
108 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-228P-201
ENST00000362700
106 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-608P-201
ENST00000383927
104 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
Y_RNA.413-201
ENST00000384007
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
Y_RNA.754-201
ENST00000476024
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
MIR3170-201
ENST00000582699
77 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-634P-201
ENST00000459134
106 nt
BASIC
-1.7
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
SNORA26.2-201
ENST00000390922
122 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-995P-201
ENST00000391244
107 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNY4P29-201
ENST00000410801
97 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-1124P-201
ENST00000384169
107 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-172P-201
ENST00000411000
93 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
Y_RNA.678-201
ENST00000516408
96 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL3
Q13618
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
RNU6-1255P-201
ENST00000363434
112 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
SNORD114-3-201
ENST00000364969
75 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
RNU6-573P-201
ENST00000383938
106 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
Y_RNA.443-201
ENST00000384135
111 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
Y_RNA.545-201
ENST00000384652
105 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
AC018880.2-201
ENST00000414265
201 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
RNY4P27-201
ENST00000363341
96 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
RNU6-663P-201
ENST00000391105
106 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
Y_RNA.223-201
ENST00000364290
113 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
RNU7-151P-201
ENST00000516930
53 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
Y_RNA.388-201
ENST00000383919
113 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
MIR1255A-201
ENST00000408338
113 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
MIR579-201
ENST00000385221
98 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
AC108019.1-201
ENST00000512540
175 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
RNU6-857P-201
ENST00000515893
110 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
MIR4756-201
ENST00000577874
78 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL3
Q13618
Y_RNA.43-201
ENST00000362670
111 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6-279P-201
ENST00000391297
101 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
MIR23C-201
ENST00000579846
100 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
SNORD60.1-201
ENST00000362451
73 nt
BASIC
-1.8
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
Y_RNA.699-201
ENST00000516803
93 nt
BASIC
-1.8
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
Y_RNA.340-201
ENST00000365330
92 nt
BASIC
-1.81
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6-118P-201
ENST00000516552
102 nt
BASIC
-1.81
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
SNORD30.1-201
ENST00000391309
70 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6-871P-201
ENST00000516122
100 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
SNORA25.4-201
ENST00000363666
124 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6-258P-201
ENST00000390884
101 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
Y_RNA.502-201
ENST00000384478
113 nt
BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
SNORD63.2-201
ENST00000516303
64 nt
BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
RNU6-1247P-201
ENST00000516622
98 nt
BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL3
Q13618
MTRNR2L9-201
ENST00000622562
75 nt
BASIC
-1.85
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNU6-669P-201
ENST00000365575
107 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
SNORD78.1-201
ENST00000390866
65 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNU6-400P-201
ENST00000391173
106 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
MIR664B-201
ENST00000626756
61 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNU6-79P-201
ENST00000362511
107 nt
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
Y_RNA.103-201
ENST00000363171
102 nt
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
MIR125B1-201
ENST00000385236
88 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
MIR7110-201
ENST00000612638
86 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
SNORA25.5-201
ENST00000363782
126 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
Y_RNA.284-201
ENST00000364806
102 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
MIR1302-4-201
ENST00000408701
150 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNA5SP225-201
ENST00000410874
135 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
Y_RNA.684-201
ENST00000516510
99 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNU6-649P-201
ENST00000384463
107 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
MIR1207-201
ENST00000408249
87 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNU6-980P-201
ENST00000516925
103 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
RNU6-231P-201
ENST00000517122
103 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
AC120024.2-201
ENST00000576526
175 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
LINC01984-201
ENST00000583863
301 nt
TSL 3
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL3
Q13618
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
BASIC
-1.92
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNU7-160P-201
ENST00000516660
62 nt
BASIC
-1.92
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
-1.92
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-1.92
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
ST7-OT3_1.1-201
ENST00000619607
74 nt
BASIC
-1.93
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
U6.111-201
ENST00000636093
83 nt
BASIC
-1.93
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNU6-539P-201
ENST00000516665
103 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNU6-563P-201
ENST00000364872
108 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
SNORD116.2-201
ENST00000391251
93 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
MIR4723-201
ENST00000585070
81 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
127 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
Y_RNA.69-201
ENST00000362885
109 nt
BASIC
-1.96
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
Y_RNA.139-201
ENST00000363464
102 nt
BASIC
-1.96
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNU6-810P-201
ENST00000364001
107 nt
BASIC
-1.96
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-1.96
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-1.97
□□□□□ -2.72
CUL3
Q13618
Y_RNA.175-201
ENST00000363794
111 nt
BASIC
-1.97
□□□□□ -2.72
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