Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PEX6Q13608 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PEX6Q13608 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PEX6Q13608 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
PEX6Q13608 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PEX6Q13608 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PEX6Q13608 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PEX6Q13608 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms