Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATRQ13535 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ATRQ13535 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ATRQ13535 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ATRQ13535 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ATRQ13535 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ATRQ13535 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ATRQ13535 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
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