Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CHD3Q12873 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CHD3Q12873 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CHD3Q12873 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CHD3Q12873 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CHD3Q12873 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms