Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CHRNEQ04844 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CHRNEQ04844 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHRNEQ04844 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHRNEQ04844 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CHRNEQ04844 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CHRNEQ04844 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHRNEQ04844 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHRNEQ04844 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHRNEQ04844 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHRNEQ04844 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHRNEQ04844 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHRNEQ04844 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms