Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-5.9□□□□□ -3.35
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-5.95□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-5.99□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-6.05□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-6.05□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-6.05□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-6.07□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-6.08□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-6.08□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-6.09□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-6.09□□□□□ -3.38
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-6.1□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-6.11□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-6.11□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-6.12□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-6.13□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-6.14□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-6.14□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-6.15□□□□□ -3.39
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-6.16□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-6.16□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-6.17□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-6.17□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-6.17□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-6.17□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-6.18□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-6.18□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-6.18□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-6.2□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-6.2□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-6.21□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-6.21□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-6.21□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-6.21□□□□□ -3.4
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-6.22□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-6.22□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-6.23□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-6.23□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-6.24□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-6.24□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-6.24□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-6.24□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-6.25□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-6.27□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.41
NRXN3Q9Y4C0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-6.28□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-6.29□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-6.3□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
NRXN3Q9Y4C0 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-6.31□□□□□ -3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms